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Ecopetrol S.A., a través del Instituto Colombiano del Petróleo, lleva a cabo proyectos de investigación con el fin de identificar, adaptar y/o desarrollar tecnologías y nuevas oportunidades de negocio de biocombustibles.
En los últimos años se han trabajado líneas de investigación de biocombustibles avanzados mediante análisis y experimentos propios o en conjunto con otras empresas, entidades educativas y centro de investigación a nivel nacional e internacional. Entre otros, se han estudiado tecnologías y procesos asociados con la producción de diesel renovable, biojet, etanol lignocelulósico, aceite de algas y otras materias primas alternativas tales como jatropha y sorgo dulce.
En Junio de 2012, La Superintendencia de Industria y Comercio de Colombia otorgó a Ecopetrol, la patente de invención de la tecnología "Proceso para obtención de diesel a partir de aceites vegetales o animales por hidrotratamiento con tiempos de residencia reducidos y productos obtenidos a partir del mismo", desarrollado en los laboratorios del Instituto Colombiano del Petróleo.
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